Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Pggt1bQ8BUY9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pggt1bQ8BUY9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms