Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hirip3Q8BLH7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms