Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp54Q8BL06 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp54Q8BL06 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms