Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdca8Q8BHX3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms