Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmc3Q7TQ69 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms