Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vma21Q78T54 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vma21Q78T54 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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