Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Smim12Q78RX3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms