Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rph3alQ768S4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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