Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Topbp1Q6ZQF0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms