Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GcsamQ6RFH4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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