Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trak1Q6PD31 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms