Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Zbtb40Q6PCS8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb40Q6PCS8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms