Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TroQ6DIC6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TroQ6DIC6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TroQ6DIC6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TroQ6DIC6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TroQ6DIC6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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