Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pdzrn3Q69ZS0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pdzrn3Q69ZS0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms