Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Pkp4Q68FH0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pkp4Q68FH0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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