Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nlrp9bQ66X22 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms