Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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