Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Taf6Q62311 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms