Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PcolceQ61398 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PcolceQ61398 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms