Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nell2Q61220 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nell2Q61220 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nell2Q61220 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nell2Q61220 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms