Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rbbp7Q60973 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms