Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rbbp4Q60972 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms