Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DbpQ60925 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
DbpQ60925 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms