Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnot7Q60809 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot7Q60809 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms