Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3aQ60520 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3aQ60520 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms