Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms