Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d1Q5SSN7 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d1Q5SSN7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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