Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc1Q5NCF2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Trappc1Q5NCF2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Trappc1Q5NCF2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Trappc1Q5NCF2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Trappc1Q5NCF2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Trappc1Q5NCF2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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