Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim58Q5NCC9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim58Q5NCC9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms