Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Herc2Q4U2R1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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