Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syne3Q4FZC9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syne3Q4FZC9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syne3Q4FZC9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syne3Q4FZC9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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