Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms