Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim9Q3V0X1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms