Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp48Q3V0C5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp48Q3V0C5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms