Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

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Length 1,264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tbc1d9Q3UYK3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tbc1d9Q3UYK3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tbc1d9Q3UYK3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms