Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pfdn4Q3UWL8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pfdn4Q3UWL8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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