Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chpf2Q3UU43 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms