Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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