Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Skap2Q3UND0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms