Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms