Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms