Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssbp4Q3U4B1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssbp4Q3U4B1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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