Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms