Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms