Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms