Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp2b3Q0VF55 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms