Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Itgb8Q0VBD0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms