Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata18Q0P557 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spata18Q0P557 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms