Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc21bQ0HA38 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms