Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
F13bQ07968 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms